2003年1月10日，国家海洋局发布2002年《中国海洋环境质量公报》和《中国海洋灾害公报》。

　　1月15日，全国海洋厅局长会议在北京召开，王曙光局长提出今后5年海洋工作思路和重点任务。

　　1月30日，中共中央政治局常委、温家宝副总理到国家海洋局慰问南极考察队员。

　　3月7日，国务院批准《省级海洋功能区划审批办法》，由国家海洋局组织实施。

　　3月21日，国家海洋局印发《海域使用论证收费标准（试行）》的通知。

　　4月19日，国务院批准《报国务院批准的项目用海审批办法》，由国家海洋局组织实施。

　　5月9日，国务院印发《全国海洋经济发展规划纲要》的通知。同日，中国海监总队在全国范围内组织开展“海盾2003”专项执法行动。

　　5月27日，中国国家海洋局局长王曙光，在莫斯科克里姆林宫与俄罗斯自然资源部部长共同签署《中华人民共和国和俄罗斯联邦政府关于海洋领域合作协议》。中国国家主席胡锦涛和俄罗斯总统普京出席签字仪式。6月17日，国家海洋局等部门联合发布《无居民海岛保护与利用管理规定》。

      6月23日，中国国家海洋局与印度海洋开发部在京签署两国《海洋科技领域的谅解备忘录》。国务院总理温家宝和印度总理瓦杰帕伊出席签字仪式。

　　6月24日，国家海洋局印发《海洋工程排污费征收标准实施办法》。

　　7月15日，中国第二次北极考察队乘“雪龙”船从大连起航。

　　7月24日，国家海洋局在乌鲁木齐召开学习贯彻《全国海洋经济发展规划纲要》厅局长会议。

　　9月3日，国家海洋局发布《海域使用面积测量规范》等4项海洋行业标准。

　　9月6日，国家海洋局印发《临时海域使用管理办法》的通知。

　　11月5日，国家海洋局印发《无居民海岛利用申请审批暂行办法》等有关制度的通知。

　　11月14日，国家海洋局印发《倾倒区管理暂行规定》。

　　11月20日，由杭州水处理中心承担的国内首套万吨级反渗透海水淡化项目在山东荣成出水。

　　12月31日，国家发改委、国家海洋局联合印发《关于编制省级海洋经济发展规划意见的通知》。