监测结果表明，绝大部分珊瑚礁、红树林和海草床生态系统处于健康状态，西沙群岛珊瑚礁生态系统，海南东海岸生态监控区内的珊瑚礁、海草床生态系统，广西北海生态监控区内的珊瑚礁、海草床及红树林生态系统以及北仑河口红树林生态系统健康状况良好，雷州半岛西南沿岸珊瑚礁生态系统处于亚健康状态。主要海湾、河口及滨海湿地生态系统处于亚健康或不健康状态。其中锦州湾、莱州湾、杭州湾和珠江口生态系统处于不健康状态，主要表现在富营养化及营养盐失衡，生物群落结构异常，河口产卵场退化，生境丧失或改变等。主要影响因素是陆源污染物排海、围填海侵占海洋生境、生物资源过度开发。连续三年的监测结果表明，我国长江口以北海域生态监控区的水质和生物群落结构略有好转，主要表现在海洋生物的密度和生物量有所恢复；长江口以南海域生态监控区的水质和生物群落结构略有下降，主要表现在水体富营养化呈增高趋势，浮游植物密度偏高，海洋动物的密度和生物量偏低。总体而言，我国近岸海洋生态系统生态环境恶化的趋势仍未得到有效缓解。   

　　双台子河口生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，5月和8月，63%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准，8月，近90%水域活性磷酸盐含量劣于四类海水水质标准；溶解氧含量较低，8月，80%水域溶解氧含量未达到二类海水水质标准的要求；石油平台附近水域仍存在一定程度的石油类污染。沉积环境质量总体良好。部分生物体内镉和铅含量偏高。生物群落结构状况一般。8月，浮游植物和浮游动物密度偏低，平均密度分别为3.6×104细胞/立方米和10 863个/立方米；5月和8月，底栖生物栖息密度偏低，平均密度分别为32.3个/平方米和25个/平方米。   

连续三年的监测结果表明，双台子河口生态系统健康状况总体上处于恢复状态，生态系统健康指数略有增加。主要表现在：河口近岸水域春季淡水注入量增加，平均盐度由2004年同期的33.32持续降为今年的31.43；生物群落结构和鱼卵、仔鱼逐渐有所恢复。但是，水体富营养化持续加重；部分生物体内镉和铅含量偏高。夏季，浮游植物和浮游动物密度偏低；春、夏季底栖生物栖息密度偏低。陆源排污和不合理的海水增养殖活动是影响双台子河口生态系统健康的主要原因。   

锦州湾生态监控区 生态系统处于不健康状态。5月，局部海域无机氮含量超二类海水水质标准；8月，全部海域无机氮含量超二类海水水质标准，局部海域超三类海水水质标准。沉积环境质量较差，受葫芦岛锌厂历史排渣等影响，锦州湾内沉积物污染依然严重。部分生物体内石油类和铅含量较高。锦州湾内沿岸围填海活动频繁，导致栖息地面积有所减小。生物群落结构状况一般，5月，浮游植物密度偏低，浮游动物密度偏高，浮游植物和浮游动物平均密度分别为9.0×104细胞/立方米和25 991个/立方米；鱼卵和仔鱼种类少，密度低；底栖生物栖息密度和生物量偏低。湾内潮间带生物种类和数量明显下降，经济种类濒临灭绝，五里河口滩涂无底栖生物分布。

    与2005年相比，锦州湾及邻近海域水体富营养化状态明显好转，活性磷酸盐含量符合一类海水水质标准，无机氮含量降低，超标面积有所减少。生物群落结构变化不大，浮游植物密度、底栖生物栖息密度和生物量、鱼卵和仔鱼等密度依然偏低。与历史调查结果相比，食物链高端的生物量显著下降，生物分布区系向湾口移动，对虾、毛虾、糠虾的分布区已经移到湾口及其近海，湾内生物资源明显减少。陆源污染和围填海工程是影响锦州湾生态系统健康的主要因素。   

滦河口—北戴河生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水和沉积环境总体质量良好。部分生物体内镉、铅和砷含量偏高。生物群落结构状况一般，8月，浮游植物密度异常偏高，平均密度达3 265×104细胞/立方米；浮游动物生物量、底栖动物栖息密度和生物量偏高，平均值分别为321毫克/立方米、881个/平方米和52毫克/平方米。5月和8月，文昌鱼栖息密度分别为117尾/平方米和64尾/平方米，生物量分别为12.81克/平方米和5.43克/平方米。

    与上年同期相比，2006年文昌鱼栖息密度及生物量均略有减少。2006年8月，浮游植物数量异常增加，平均密度是上年同期的近30倍，导致浮游动物生物量、底栖动物栖息密度和生物量也都相应增加，其中，浮游动物平均生物量是2005年同期平均生物量的2倍，底栖动物栖息密度和生物量分别是上年同期的3倍和2倍。近年来，生态监控区内海水养殖业发展迅速，海水养殖已接近或超过养殖容量，养殖自身污染对滦河口—北戴河生态系统形成了潜在威胁。   

渤海湾生态监控区 生态系统处于亚健康状态。5月，30%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；8月，80%水域无机氮含量和30%水域活性磷酸盐含量劣于四类海水水质标准，水体呈严重富营养化状态，营养盐失衡。沉积环境总体质量良好。部分生物体内总汞、铅、砷和镉的含量偏高。围填海面积达数10平方公里，栖息地面积减小。生物群落结构状况较差，5月，浮游植物密度偏高，平均密度为78×104细胞/立方米；5月和8月浮游动物密度偏高，平均数量分别为27 176个/立方米和22 748个/立方米；5月，底栖生物栖息密度和生物量偏低，平均值分别为35个/平方米和9克/平方米；产卵场退化，鱼卵、仔鱼种类少，密度低，鱼卵平均密度为6个/立方米，仔鱼平均密度为6尾/立方米。

    连续三年的监测结果表明，渤海湾水环境质量出现波动，2006年水环境指数高于2004年，略低于2005年，水体富营养化是影响水环境质量的主要因素。生物群落结构状况变化亦呈相同趋势。大规模围填海工程使天然滨海湿地面积大幅减小，导致许多重要的经济鱼、虾、蟹和贝类等海洋生物的产卵、育苗场所消失，海洋渔业资源遭受严重损害，长途迁徙的鸟类饵料数量减少，削弱了鸟类栖息地的功能，生物多样性迅速下降。陆源污染和围填海工程等是影响渤海湾生态系统健康的主要因素。   

莱州湾生态监控区 生态系统处于不健康状态。水体富营养化严重，营养盐严重失衡，5月，90%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准，8月，近30%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准，近40%水域石油类含量超二类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内总汞、砷、镉、铅和石油类的含量偏高。栖息地状况较差，筑路、护堤、围海造陆、兴建盐田和养殖池塘使滨海湿地面积严重萎缩。生物群落结构状况较差，浮游植物密度偏高，5月和8月浮游植物平均密度分别为31×104细胞/立方米和1 140×104细胞/立方米；5月，浮游动物密度和生物量偏高，平均值分别为79 130个/立方米和304毫克/立方米，底栖生物栖息密度偏低，平均密度为190个/平方米；产卵场严重退化，鱼卵、仔鱼种类少，密度低。

    连续三年的监测结果表明，莱州湾生态系统健康状况总体处于恢复状态，生态系统健康指数略有增加。主要表现在水体富营养化面积缩减；生物群落结构略有改善，鱼卵、仔鱼种类与数量增加。但水体富营养化依然严重，石油类含量超标面积有所增加；部分生物体内总汞、砷、镉、铅和石油类的含量偏高。浮游植物和浮游动物密度偏高；底栖生物栖息密度偏低，鱼卵、仔鱼种类与密度依然维持在低水平。陆源排污、围填海工程和不合理养殖活动等是导致莱州湾生态系统不健康的主要因素。   

黄河口生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，营养盐严重失衡，5月，90%海域无机氮含量劣于四类海水水质标准，8月，60%海域无机氮含量劣于四类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内总汞、砷、镉、铅和石油类的含量偏高。生物群落结构状况一般，8月，浮游植物密度偏高，平均密度为2 357×104细胞/立方米；5月，底栖动物栖息密度偏低，平均栖息密度为73个/平方米。产卵场退化，鱼卵、仔鱼的种类少，密度低。

    连续三年的监测结果表明，黄河口生态系统健康状况总体处于恢复状态，生态系统健康指数明显增加。随着黄河来水量的明显增加，生物群落结构略有改善，浮游植物密度、浮游动物密度和生物量渐趋于正常，底栖生物栖息密度也略有好转。但水体富营养化仍然严重；部分生物体内总汞、砷、镉、铅和石油烃的含量偏高。底栖生物栖息密度偏低，鱼卵、仔鱼种类少，密度低。陆源排污、黄河来水量和过度捕捞等是影响黄河口生态系统健康的主要因素。   

苏北浅滩生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水体呈富营养化， 20%海域无机氮含量超三类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内镉含量偏高。生物群落结构状况一般，5月，浮游动物密度明显偏低，生物量偏高，平均值分别为3 893个/立方米和2 934毫克/立方米；底栖生物栖息密度和生物量偏低，5月，平均值分别为0.38个/立方米和0.34毫克/立方米，8月，平均值分别为0.14个/立方米和0.16毫克/立方米。鱼卵、仔鱼平均密度分别为128个/立方米和81个/立方米。

    连续三年的监测结果表明，苏北浅滩生态系统健康状况总体处于稳定状态，生态系统健康指数变化不大。水体富营养化程度与范围呈下降趋势，鱼卵和仔鱼数量持续增加，底栖生物栖息密度和生物量仍然偏低。陆源排污、滩涂围垦和过度捕捞等是威胁苏北浅滩湿地生态系统健康的主要因素。

    长江口生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，营养盐失衡，60%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；8月，40%海域活性磷酸盐含量劣于四类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内铜、锌、砷、镉和铅含量偏高。长江口栖息地状况一般，全年滩涂围垦4.13平方公里。生物群落结构状况较差，8月，浮游植物密度偏高，平均密度为1 962×104细胞/立方米；浮游动物密度和生物量明显偏低；5月，底栖生物栖息密度和生物量偏高，平均栖息密度和生物量分别为114个/平方米和26克/平方米；产卵场退化，鱼卵、仔鱼的种类少，密度低，平均每百立方米有7个鱼卵和29尾仔鱼。

    连续三年的监测结果表明，长江口生态系统健康状况总体处于恢复状态，生态系统健康指数有所增加。长江口水体富营养化范围有所缩减，活性磷酸盐和无机氮劣四类海水水质的海域面积与上年同期相比减少了20%左右。监控区内围填海监管得到加强，2005~2006年，围垦速率降低了89.9%。长江冲淡水区域生物群落结构基本保持稳定。但水体富营养化仍然严重；部分生物体内铜、锌、砷、镉和铅含量偏高。长江口生物群落结构状况总体上仍然较差，长江口门以内区域生物群落结构趋于简单，鱼卵、仔鱼种类少，密度低。陆源排污、长江来水量和滩涂围垦等是威胁长江口生态系统健康的主要因素。

    杭州湾生态监控区 生态系统处于不健康状态。水体呈严重富营养化状态，营养盐失衡，全部水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；4月，近40%水域活性磷酸盐含量超三类海水水质标准，8月，近80%水域活性磷酸盐含量超三类海水水质标准，其中，30%水域劣于四类海水水质标准；4月，近90%水域石油类含量超一类海水水质标准，8月，近40%水域石油类含量超一类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内石油类和铅含量略高。栖息地面积缩减。生物群落结构状况较差，浮游植物密度异常偏高，4月和8月平均密度分别为25 606×104细胞/立方米和34 967×104细胞/立方米；浮游动物密度明显偏低，3月和8月平均密度分别为339个/立方米和825个/立方米；4月，底栖生物栖息密度偏低，平均栖息密度为19个/平方米；产卵场退化，鱼卵、仔鱼种类少，密度低。

    连续三年的监测结果表明，杭州湾生态系统始终处于不健康状态，生态系统健康指数变化不大。水体呈严重富营养化状态，营养盐失衡，无机氮含量持续增高，活性磷酸盐含量和超标面积呈下降趋势；石油类含量超一类海水水质标准面积继续扩大；沉积物中多氯联苯含量呈增加趋势。近五年来杭州湾湿地面积每年减少5％以上。生物群落结构状况依然较差，浮游植物密度继续呈上升趋势；浮游动物和底栖生物栖息密度仍然偏低；鱼卵、仔鱼种类少，密度低。陆源排污、滩涂围垦以及长江来水量等是导致杭州湾生态系统不健康的主要因素。

    乐清湾生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水体呈严重富营养化状态，营养盐失衡，4月，全部水域无机氮含量劣于四类海水水质标准，8月，20%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；4月，几乎全部水域活性磷酸盐含量超三类海水水质标准，8月，50%水域活性磷酸盐含量超三类海水水质标准，其中，近30%水域劣于四类海水水质标准；4月，30%水域石油类含量超一类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内镉、铅和总汞含量较高。栖息地面积减少，底质环境发生改变。生物群落结构状况一般，浮游植物密度偏高，4月和8月平均密度分别为91×104细胞/立方米和6 454×104细胞/立方米；8月浮游动物密度和生物量偏低，平均值分别为1 608个/立方米和103毫克/立方米；4月，底栖生物栖息密度和生物量偏低，分别平均为6.7个/平方米和1.5克/平方米。

    连续三年的监测结果表明，乐清湾生态系统健康状况总体处于稳定状态，生态系统健康指数变化不大。水体呈严重富营养化状态，营养盐失衡，无机氮含量呈增高趋势，活性磷酸盐含量和超标面积呈下降趋势；石油类含量超一类海水水质标准，超标面积较大。生物群落结构状况一般，浮游植物密度持续偏高；浮游动物和底栖生物密度偏低。陆源排污、围海造地、不合理的海岸工程和海水养殖是威胁乐清湾生态系统健康的主要因素。   

闽东沿岸生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水体有富营养化的倾向，5月，30%水域无机氮含量超三类海水水质标准，其中， 15%水域劣于四类海水水质标准；5月和8月，40%左右水域溶解氧超一类海水水质标准。沉积环境总体质量良好。部分生物体内砷、镉、铅和总汞含量较高。栖息地面积减小。生物群落结构状况一般，浮游植物密度偏高，5月和8月的平均密度分别为1 469×104细胞/立方米和2 112×104细胞/立方米；8月，浮游动物密度偏高，平均密度为8 397个/立方米。遥感监测结果表明主要外来物种互花米草分布面积已达10 000公顷，是十年前的两倍多。

    连续三年的监测结果表明，闽东沿岸生态监控区生态系统健康状况总体处于稳定状态，生态系统健康指数变化不大。油类、无机氮和活性磷酸盐含量呈增高趋势。受围填海影响，沿岸栖息地面积缩小。生物群落结构状况一般，浮游植物密度持续偏高。围填海、陆源排污、海水养殖、过度捕捞和外来物种入侵等是威胁闽东沿岸生态系统健康的主要因素。   

大亚湾生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水环境和沉积环境总体质量良好。部分生物体内铅、镉和石油类含量较高。栖息地面积减小，约70%的海岸带区域已被开发，其中8%已完全改变了自然属性。生物群落结构状况一般，4月，浮游植物密度偏高，平均密度为410×104细胞/立方米； 8月，浮游动物密度偏低，平均密度为8 720个/立方米；8月，底栖生物栖息密度和生物量偏低,平均值分别为50个/平方米和27克/平方米；鱼卵、仔鱼密度偏低，4月，鱼卵平均密度为1.3个/立方米，仔鱼平均密度为1.1尾/立方米，8月，鱼卵平均密度为10.9个/立方米，仔鱼平均密度为7.7尾/立方米。

    连续三年的监测结果表明，大亚湾生态监控区生态系统健康状况总体上处于稳定状态，生态系统健康指数变化不大。局部海域水体中无机氮和活性磷酸盐含量呈增高趋势。生物群落结构状况一般，浮游动物、底栖生物和鱼卵、仔鱼密度持续偏低。大亚湾核电站的温排水对海区生物群落结构的负面影响显著，群落结构趋于简单，不稳定性增加，珊瑚白化现象加重。围填海、海水养殖、“热污染”和陆源排污是威胁大亚湾生态系统健康的主要因素。   

珠江口生态监控区 生态系统处于不健康状态。水体呈严重富营养化状态，营养盐失衡，几乎全部水域无机氮含量劣于四类海水水质标准； 4月，近30%水域溶解氧含量未能达到二类海水水质标准要求，8月，40%水域溶解氧含量未能达到二类海水水质标准要求。沉积环境总体质量良好。部分生物体内铅、镉、砷和石油类含量较高。受自然因素和围填海等人为因素影响，栖息地变化较大。生物群落结构状况一般，浮游植物密度偏高，4月，浮游植物平均密度为2 511×104细胞/立方米；8月，浮游动物密度偏低，平均密度为8 915个/立方米；8月，底栖生物的栖息密度和生物量偏低，平均值分别为29个/平方米和13.5克/平方米；鱼卵、仔鱼密度偏低，4月，鱼卵平均密度为12.4个/立方米，仔鱼平均密度为0.74尾/立方米，8月，鱼卵平均密度为0.79个/立方米，仔鱼平均密度为2.9尾/立方米。珠江口水域环境质量恶化，对中华白海豚种群的生存构成了严重威胁。

    连续三年的监测结果表明，珠江口生态监控区生态系统始终处于不健康状态。海域水质面临的最主要问题是富营养化，生活污水已经成为珠江口的重要污染因素。生物群落结构状况一般，浮游植物密度持续偏高，浮游动物、底栖生物和鱼卵、仔鱼密度持续偏低。围填海、陆源排污和不合理的海水养殖是引起珠江口生态系统健康状况下降的主要因素。

    雷州半岛西南沿岸生态监控区 生态系统处于亚健康状态。水环境和沉积环境总体质量良好。栖息地状况良好。生物群落结构状况较差，徐闻珊瑚礁活珊瑚盖度为16.3%～31.0%，珊瑚的死亡率为24.3%～41.7%，死亡时间均在两年以上，未发现珊瑚礁病害及近期死亡珊瑚，珊瑚礁总体处于稳定和初步恢复阶段。5月，浮游植物密度偏低，平均密度为14×104细胞/立方米；浮游动物密度偏低，5月和8月平均密度分别为77个/立方米和102个/立方米；底栖生物的栖息密度偏低，5月和8月，平均密度分别为42个/平方米和46个/平方米；鱼卵、仔鱼密度偏低，平均密度分别为1.7个/立方米和0.5尾/立方米。

    连续三年的监测结果表明，雷州半岛西南沿岸生态监控区生态系统健康状况有所下降，主要表现在生物群落结构状况较差，浮游植物、浮游动物和底栖生物的密度偏低，鱼卵、仔鱼种类少，密度低。陆源排污、超负荷的水产养殖和过度捕捞仍然是威胁近岸珊瑚礁生态健康的主要因素。

    广西北海生态监控区 生态系统处于健康状态。水环境和沉积环境质量良好。栖息地状况和生物群落结构状况良好。监测结果表明红树植物种类多样性丰富，红树林生境完整，群落结构稳定。海塘区红海榄单优群落盖度为90%以上，成体红海榄母树发育状况良好，平均株高3.0米，最高4.8米，平均胸径6.67厘米，最大11.5厘米；高坡为两层结构的乔木型木榄单优群落，盖度为85%～90%，群落平均株高3.3米，最高4.1米，平均胸径6.7厘米，最大15.9厘米；永安区群落平均株高4.6米，最高5.9米，平均胸径7.0厘米，最大13.3厘米，覆盖度95%以上；沙田区为单层灌木型群落，盖度为70%左右，群落平均株高1.6米，最高2.3米；1998年用红海榄、木榄和秋茄等3种胚轴苗直插法恢复的区域，次生林群落恢复良好，已基本具备防风挡浪护堤功能。

    与1996年相比，山口红树林区鸟类种类数量明显增加，种群不断增大，留鸟数量逐年增多。本年度共记录到鸟类121种，其中，新记录的鸟类有55种，属国家重点保护的鸟类有10种，占该保护区鸟类总种数的8.1%，并记录到极其濒危种黑脸琵鹭的分布，表明红树林生态系统健康稳定。但从2005年开始，本区红树林相继发生了由广州小斑螟和丝脉衰蛾引起的虫害。白骨壤广州小斑螟虫害面积约1 300亩，主要分布在沙田、永安、白沙和武留江口，白骨壤叶片的平均受害率为26.1%。其中沙田和永安白骨壤单优群落分布区比较严重，面积约350亩。与2005年相比，广州小斑螟有所减轻。

    北海海草床主要分布于淀沙洲下量尾和英罗港乌坭，两处均为喜盐草单生。下量尾海草长势较好，绿色海草斑块基本完整，乌坭处海草长势差，多呈零星分布状态，两处的海草盖度分别为20%和5%，栖息密度分别为158株/平方米和172株/平方米，海草生物量分别为11.0 克/平方米和3.6克/平方米；海草分布区底栖动物栖息密度分别为54个/平方米和35个/平方米，生物量分别为153.8 克/平方米和115.3克/平方米。

    涠洲岛近岸珊瑚礁分布区水质良好，符合一类海水水质标准，珊瑚礁基本处于稳定状态。其中，竹蔗寮-西拱手近岸海域的活珊瑚礁盖度为21.3%～50.0%，牛背坑近岸海域为38.1%。但珊瑚礁鱼类和底栖生物仍处于低水平。
连续三年的监测结果表明，广西北海生态监控区生态系统健康状况总体上处于稳定状态，生态系统健康指数有所增加。互花米草入侵、炸鱼、偷猎等是该区生态系统健康的主要威胁。

    北仑河口生态监控区 生态系统处于健康状态。水环境和沉积环境总体质量良好。栖息地和生物群落结构状况良好。监测结果表明，北仑河口红树林重要分布区成体红树林群落稳定，幼苗补充区域幼体发育良好，恢复区域效果明显，红树林群落处于健康状态。其中，石角区域是我国连片面积最大的红树林区，主要分布的红树植物种类有木榄、桐花树、秋茄及白骨壤等，该区红树林生长受人类开发性破坏较小，群落结构稳定。由岸向海依次分布白骨壤-桐花树混交群落、木榄群落及桐花树-秋茄混交群落。白骨壤-桐花树混交群落内植株平均株高1.72米，最高3.70米，平均胸径5.05厘米，最大23.89厘米，单面冠幅最大570厘米；木榄群落植株平均株高2.12米，最高3.60米，平均胸径5.61厘米，最大19.11厘米，单面冠幅最大530厘米；桐花树-秋茄混交群落平均株高124厘米，最高190厘米，平均胸径4.16厘米，最大13.69厘米。

    交东区域近岸一侧为秋茄群落，近海一侧为木榄单生群落。秋茄群落植株平均高度为175.7厘米，最高240厘米，平均胸径10.7厘米，最大29.3厘米，单面冠幅最大240厘米；木榄群落植株平均株高2.96米，最高4.10米，平均胸径9.7厘米，最大21.7厘米，单面冠幅最大480厘米，整体群落荫蔽度90％以上。

    竹山区域以桐花树和白骨壤为主。该区桐花树纯林整体郁闭度达90％以上，植株平均株高1.6米，最高2.0米，平均胸径8.8厘米，最大23.9厘米，单面冠幅最大200厘米。林下集生的桐花树幼苗大部分为高为15～30 厘米的双子叶幼苗，平均密度高达7.7株/平方米，发育良好。

    独墩岛上分布有典型的河口红树植物群落类型——卤蕨群落和老鼠簕群落。2000年受池塘养殖开发影响，岛上红树林曾一度受到较大范围的破坏。2002年人工种植的老鼠簕种群经过两年多的生长，群落覆盖度达40%，群落密度1丛/平方米，平均植株高度为1.2 米，平均分蘖数约4株/棵，人工恢复效果明显。

    北仑河口红树林生态系统位于亚洲东部沿海鸟类迁徙路线和中西伯利亚-中国中部鸟类迁徙路线的交汇区，是候鸟重要繁殖地和迁徙停歇地。8月和10月的两次监测共观察到鸟类76种，其中国家二级重点保护鸟类9种，还首次记录了广西新种——北椋鸟，表明北仑河口红树林生态系统处于健康状态。另外，红树林区底栖动物丰富，平均栖息密度和生物量分别为274个/平方米和82.54克/平方米。

    与2005年相比，北仑河口生态监控区生态系统健康状况总体上处于稳定状态，生态系统健康指数有所增加。生活污水、养殖废水的直接排放及虫害是威胁北仑河口红树林健康的主要因素。   

海南东海岸生态监控区 生态系统处于健康状态。水环境和沉积环境总体质量良好。部分生物体内铅、砷、镉和总汞含量较高。海南东海岸珊瑚礁主要分布区是鹿回头、大小东海、东瑁州、西瑁州、东西排岛、蜈支洲、长玘港等。水质监测结果显示，绝大部分珊瑚礁分布区水质符合一类水质标准，但三亚鹿回头海域大部分为二类海水，局部为四类或劣四类海水水质，污染因子为活性磷酸盐，海水水质总体下降。上述珊瑚礁分布区造礁石珊瑚种类多样性丰富，共有13科27属82种分布。珊瑚礁健康状况总体良好，活造礁石珊瑚覆盖度平均值为25.9%，其中，蜈支洲最高，活造礁石珊瑚覆盖度为41.9%，长玘港活造礁石珊瑚覆盖度最低，为7.5%。

    硬珊瑚补充量平均值为0.12个/平方米；鹿回头的硬珊瑚补充量最高，为0.29个/平方米；长玘港的硬珊瑚补充量最低，为0.01个/平方米。珊瑚礁退化指数评价结果显示，多数珊瑚礁退化指数低，珊瑚礁生态系统总体处于健康稳定状态。但受渔业活动干扰、养殖污水直接排放及港内悬浮泥砂含量增加的影响，长玘港活珊瑚覆盖度低，珊瑚死亡率高，石珊瑚补充量低，珊瑚礁出现退化现象，退化指数为2.2。珊瑚礁鱼类种类及数量普遍增多，珊瑚礁鱼类密度为35尾/100平方米，但受长期过度捕捞的影响，监测到的鱼类个体普遍较小。

    海南东海岸海草床主要分布于近岸珊瑚礁坪内侧的沿岸港湾和一些泻湖沿岸。海草分布区局部区域水质明显改善，均符合国家一类海水水质标准。海草主要分布区海草种类丰富，共有8种海草分布，其中，泰莱草和海菖蒲在海草床各生态监控区均有大面积分布，是海南东部优势海草种类。多数海草分布区海草生长繁茂，海草床伴生鱼类、贝类、甲壳类等海洋生物多样性丰富，达76种。受渔业活动影响，长玘港海草床生物量下降，出现退化现象。

    连续三年的监测结果表明，海南东海岸生态监控区生态系统健康状况总体上处于稳定状态，生态系统健康指数略有减少。陆源排污、炸鱼等非法渔业活动以及超容量的旅游活动依然是海南东海岸生态系统的主要威胁。   

　　西沙群岛生态监控区 生态系统处于健康状态。水环境和沉积环境总体质量良好。部分生物体内铅含量较高。西沙群岛珊瑚礁属于印度-西太平洋造礁珊瑚区系的中心之一，是我国近海海域目前保存完好的珊瑚礁区域，也是我国现存珊瑚礁群落中最原始和最珍贵的群落。

    监测结果表明，西沙群岛附近海域各项监测指标均优于一类海水水质标准，透明度达20～30米，海水水质状况优良；珊瑚礁主要分布区永兴岛、西沙洲、北岛、赵述岛和石岛的珊瑚礁种类丰富，活珊瑚覆盖度高，珊瑚礁鱼类极为丰富。上述区域共有9科15属34种造礁石珊瑚分布，另有8属50余种软珊瑚分布。西沙群岛活珊瑚平均盖度为56.2%，永兴岛、西沙洲、北岛、赵述岛和石岛活珊瑚覆盖度分别为76.3%、64.7%、63.5%、53.4%和22.7%；西沙群岛硬珊瑚补充量平均为1.2个/ 平方米，其中石岛最高，为5.1个/平方米，其次为赵述岛、北岛和西沙洲，硬珊瑚补充量分别为0.4个/平方米、0.2个/平方米和0.2个/平方米，永兴岛的硬珊瑚补充量最低，为0.02个/平方米。珊瑚礁鱼类种类丰富，种群数量高，平均密度可达310尾/100平方米，其中石岛540尾/100平方米，其次北岛为300尾/100平方米，西沙洲和赵述岛分别为235尾/100平方米和285尾/100平方米，较少是永兴岛达到190尾/100平方米。

    与2005年相比，西沙珊瑚礁生态监控区生态系统健康状况总体处于稳定状态，生态系统健康指数有所增加。珊瑚礁退化指数评价结果显示，永兴岛的珊瑚退化指数为5.9，出现退化趋势，主要是由于永兴岛珊瑚出现细菌病（发病率为5.9%），死亡率高（11.6%）和硬珊瑚补充量低（0.02个/平方米）所导致的；其它区域珊瑚退化指数低，珊瑚生态健康状况良好。西沙珊瑚礁生态系统相对较稳定，近年来，气候变暖和各种人为因素造成的环境改变导致永兴岛南部分叶状蔷薇珊瑚死亡。另外，对珊瑚礁经济生物的掠夺性捕捉，大车磲、龙虾等珍稀生物以及马蹄螺、石斑鱼等经济生物大量减少，对西沙群岛珊瑚礁生态系统构成潜在威胁。