2007年，国家海洋局对18个生态监控区进行了生态监测。监控区总面积达5.2万平方公里，主要生态类型包括海湾、河口、滨海湿地、珊瑚礁、红树林和海草床等典型海洋生态系统。监测内容包括环境质量、生物群落结构、产卵场功能以及开发活动等。

2007年全国海洋生态监控区基本情况

2007年海洋生态监控区生态健康状态

　　监测结果表明，绝大部分珊瑚礁、红树林和海草床生态系统处于健康状态，西沙群岛珊瑚礁生态系统，海南东海岸生态监控区内的珊瑚礁、海草床生态系统，广西北海生态监控区内的珊瑚礁、海草床及红树林生态系统以及北仑河口红树林生态系统健康状况良好，雷州半岛西南沿岸生态监控区珊瑚礁生态系统处于亚健康状态。主要海湾、河口及滨海湿地生态系统处于亚健康或不健康状态，其中锦州湾、莱州湾、杭州湾和珠江口生态系统处于不健康状态，连续四年的监测结果表明，我国海湾、河口及滨海湿地生态系统存在的主要生态问题是富营养化及氮磷比失衡、环境污染、生境丧失或改变、生物群落结构异常和河口产卵场退化等。主要影响因素是陆源污染物排海、围填海活动侵占海洋生境、生物资源过度开发。总体而言，我国近岸海域生态系统健康状况恶化的趋势尚未得到有效缓解。

　　双台子河口生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，春季全部水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；水体受到石油类污染，石油类含量超一类海水水质标准，夏季超标率达100%。部分生物体内镉和铅含量偏高，100%的生物残毒检测样品镉含量偏高，25%的检测样品铅含量偏高。生物群落结构异常，浮游动物平均密度高于正常波动范围，春季为38 060个/立方米，夏季为61 399个/立方米；底栖生物的栖息密度仍然明显低于正常波动范围，春季仅为16.6个/平方米，夏季为55.8个/平方米。
　　连续四年的监测结果表明，双台子河口生态系统存在的主要生态问题是富营养化加剧、石油类和重金属等污染加重、生物群落结构异常。主要原因是陆源排污和不合理的海水增养殖活动。

　　锦州湾生态监控区  生态系统处于不健康状态。50%海域无机氮含量超二类海水水质标准。沉积环境质量较差，部分测站重金属、硫化物和石油类含量超海洋沉积物质量三类标准，生物体内石油烃和铅含量较高。湾内栖息地面积减小。生物群落结构异常，浮游植物密度明显低于正常波动范围，春季仅为5.9×104个细胞/立方米；浮游动物密度低于正常波动范围，夏季为9 423个/立方米；鱼卵和仔鱼的种类少，密度低，春季鱼卵平均密度为10.5个/立方米，仔鱼平均密度为1.2尾/立方米；锦州湾内生物种类明显下降，五里河口滩涂无潮间带生物分布。

五里河入海口	葫芦岛锌厂内综合污水处理池

　　三年连续监测结果表明，锦州湾生态系统存在的主要生态问题是环境污染、生境丧失和生物群落结构异常。主要影响因素是陆源污染物排海和频繁的围填海活动。
　　滦河口—北戴河生态监控区  生态系统处于亚健康状态。部分生物体内镉、铅和石油烃含量偏高。浮游植物明显高于正常波动范围，春季和夏季浮游植物细胞平均密度分别为103×104个细胞/立方米和1 560×104个细胞/立方米；浮游动物密度夏季也高于正常范围，为18 708个/立方米；文昌鱼栖息密度为119.2个/平方米，约为2003年以前文昌鱼栖息密度的50%。

　　连续四年的监测结果表明，滦河口—北戴河生态监控区主要生态问题为生境改变和文昌鱼数量减少。导致文昌鱼数量下降和种群退化的主要原因是海水养殖规模扩大，由养殖污染物诱发沉积物组分改变以及适宜文昌鱼生长的栖息地缩减等。
　　渤海湾生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体呈严重富营养化状态，氮磷比严重失衡，春季，40%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；秋季，53%水域无机氮含量和17%水域活性磷酸盐含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内砷的含量偏高。生物群落结构状况一般，浮游植物和浮游动物数量高于正常波动范围，浮游植物细胞平均密度春季为102×104个细胞/立方米，浮游动物平均密度春季为48 059个/立方米，夏季为17 406个/立方米；鱼卵和仔鱼的种类少，密度低。

　　连续四年的监测结果表明，城市化进程加快带来的环境压力尚未缓解，水体富营养化加剧、滨海湿地面积急剧减小等生态问题仍然突出。影响渤海湾海域生态系统健康的主要因素是陆源污染、过度捕捞和大规模围填海工程等。
　　黄河口生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，氮磷比严重失衡，春季，全部水域无机氮含量超三类海水水质标准；秋季，63%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内砷、镉、铅和石油烃的含量偏高。生物群落结构状况异常，浮游植物和浮游动物数量春季高于正常波动范围，物种多样性和均匀度较差，浮游植物平均密度为236×104个细胞/立方米，物种多样性指数变化范围为0.01~2.69，平均为1.11，均匀度变化范围为0.004~0.80，平均为0.36；小型浮游动物平均密度为140 773个/立方米，物种多样性指数变化范围为0.02~1.17，平均为0.74，均匀度变化范围为0.01~0.70，平均为0.35；产卵场退化，鱼卵和仔鱼的种类少，密度低。 

　　近四年的监测结果显示，随着人工调控黄河水资源措施的实施，黄河来水量明显增加，湿地生态环境质量出现改善迹象，黄河口生态系统健康状况总体处于恢复状态。但黄河口面临的水体无机氮含量超标严重、氮磷比严重失衡、渔业生物资源衰退等生态问题仍严重。陆源排污、黄河来水量偏低、油田开发建设、过度养殖和捕捞等仍然是黄河口生态系统健康的主要影响因素。
　　莱州湾生态监控区  生态系统处于不健康状态。水体富营养化严重，氮磷比严重失衡，春季，60%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；秋季，80%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内砷、镉、铅和石油烃的含量偏高。生物群落结构状况异常，浮游植物和浮游动物数量春季高于正常波动范围，物种多样性和均匀度较差，浮游植物平均密度为610×104个细胞/立方米，物种多样性指数变化范围为0.003~3.25，平均为1.28，均匀度变化范围为0.002~0.91，平均为0.38；小型浮游动物平均密度为70 775个/立方米，物种多样性指数变化范围为0.06~1.30，平均为0.64，均匀度变化范围为0.03~0.90，平均为0.34；春季底栖生物平均栖息密度低于正常波动范围，为185个/平方米，物种多样性指数一般，春季变化范围为0.49~3.71，平均为2.35，自2004年以来逐年降低。产卵场退化，鱼卵和仔鱼的种类少，密度低。栖息地状况较差，80%海域沉积物主要组分发生明显变化。

　　近几年的监测结果表明，陆源排污量增多、湿地减少和黄河径流入海量减少等导致了莱州湾海域环境质量下降，海洋经济生物产卵场萎缩，渔业资源衰退，底栖生物多样性下降。此外，2001年从江苏引种的泥螺成为莱州湾入侵种，分布范围逐年扩大，目前超过80%的潮间带滩涂均有泥螺分布。在局部区域，泥螺已替代土著种类托氏昌螺成为优势种，最高栖息密度达160个/平方米以上。
　　苏北浅滩生态监控区  生态系统处于亚健康状态。秋季，75%水域活性磷酸盐超三类海水水质标准，秋季水体富营养化严重，氮磷比失衡。部分生物体内石油烃和镉含量偏高。生物群落结构状况较差，主要生物类群数量明显低于正常波动范围，春季底栖生物平均栖息密度和生物量分别为0.28个/平方米和0.17克/平方米；夏季底栖生物平均栖息密度为0.48个/平方米，平均生物量为0.31克/平方米。鱼卵数量持续增加，达到167个/立方米。

　　四年的连续监测结果显示，由于苏北沿岸自然保护区管理力度加大，使得该生态区健康状况基本稳定，渔业资源略有恢复，鱼卵和仔鱼数量逐年微升。但是区域环境污染、渔业资源衰退，特别是潮间带底栖生物多样性急剧减少等生态问题尚未得到有效遏制，其主要原因是陆源排污和滩涂围垦等。
　　长江口生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体呈严重富营养化状态，氮磷比严重失衡，春季，20%水域活性磷酸盐含量劣于四类海水水质标准，70%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准；秋季，52%水域活性磷酸盐含量超三类海水水质标准，65%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内砷、镉、铅和石油烃的含量偏高。生物群落结构状况较差，浮游植物物种多样性和均匀度较差，夏季物种多样性指数变化范围为0.48~2.74，平均为1.41，均匀度变化范围为0.16~0.70，平均为0.38；浮游动物密度低于正常波动范围，春季和夏季浮游动物的密度分别为470个/立方米和2 287个/立方米。产卵场退化，鱼卵和仔鱼的种类少，密度低。
　　监测结果显示，与20世纪90年代前相比，长江口门内区域浮游生物、底栖生物和潮间带生物种类数都呈明显下降趋势。生物群落结构也发生显著变化，浮游植物硅藻比重减少，甲藻增加；底栖生物向小型化及非经济生物种类演变，经济价值明显降低；国家保护物种如白暨豚和胭脂鱼等几乎灭绝。长江口生态系统更加脆弱，外来海洋生物入侵风险增大。影响长江口生态系统健康的主要因素是陆源排污、长江来水量不足和滩涂围垦等。

　　杭州湾生态监控区  生态系统处于不健康状态。水体呈严重富营养化状态，氮磷比严重失衡，全部水域无机氮含量及部分水域活性磷酸盐含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内石油烃和铅含量偏高。生物群落结构状况较差，春季和夏季浮游植物细胞密度明显高于正常波动范围，平均密度分别为20 850×104个细胞/立方米和27 100×104个细胞/立方米；春季和夏季底栖生物栖息密度低于正常波动范围，分别为6.67个/平方米和12.85个/平方米；潮间带生物多样性急剧减少，30%以上的站位未采到生物。鱼卵和仔鱼的种类少，密度低，春季鱼卵和仔鱼平均密度分别为1.14个/立方米和0.45尾/立方米。

　　连续四年的监测结果显示，杭州湾生态系统始终处于不健康状态,主要生态问题是环境污染和围填海造成的生物多样性下降。长江、钱塘江、甬江及曹娥江每年携带大量污染物进入杭州湾水域，严重影响了杭州湾海洋生态系统健康，造成海域生物多样性下降。围填海工程占用了大量滩涂湿地面积，侵占了潮间带生物栖息地，破坏了潮间带生物资源。
　　乐清湾生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，氮磷比失衡，全部水域活性磷酸盐含量超三类海水水质标准；大部分水域无机氮含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内砷、镉和铅含量较高。生物群落结构状况异常，夏季浮游植物细胞密度高于正常波动范围，平均密度为7 524×104个细胞/立方米；春季浮游动物密度明显低于正常波动范围，平均密度为871个/立方米。栖息地面积减少，20世纪50年代以来，约38％的海涂已被围垦，面积达82.9平方公里。湾内流场和水动力条件改变，致使底质环境发生变化。

　　连续四年的监测结果表明，乐清湾生态系统存在的主要生态问题为富营养化、环境污染、生境改变或丧失。主要影响因素是陆源排污、围海造地、不合理的海岸工程和海水养殖。
　　闽东沿岸生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体富营养化加重，无机氮含量增高，劣四类海水面积扩大。部分生物体内砷、铅、镉、总汞和滴滴涕含量较高。生物群落结构状况一般，浮游植物数量高于正常波动范围，物种多样性和均匀度处于一般水平，春季浮游植物平均密度为5 818×104个细胞/立方米，物种多样性指数变化范围为0.46~3.73，平均为2.14，均匀度变化范围为0.12~0.80，平均为0.48；底栖生物密度低于正常波动范围，物种多样性处于一般水平，春季平均栖息密度为117个/平方米，是正常值的39%，物种多样性指数变化范围为0.94~3.79，平均为2.41。

　　宁德市的红树林是我国大陆红树林自然分布的地理北界，种类较单一，以秋茄为主。近年来，由于工程建设侵占、盲目砍伐、海洋污染及互花米草的蔓延，红树林面积逐年减少。红树林生态系统特别保护区建立后，加强了天然红树林保护，目前，全区红树林面积保持在111公顷。
　　闽东沿岸生态监控区鸟类栖息地众多，鸟类资源丰富，包括国家一级保护鸟类遗鸥，国家二级保护鸟类黄嘴白鹭、鹗等等。受围填海影响，沿岸栖息地面积缩小，珍稀鸟类生存环境受到威胁。
连续四年的监测结果表明，闽东沿岸生态系统的主要生态问题为富营养化、生物多样性降低和生境受损。主要影响因素是陆源排污、围海造地和资源过度开发。
　　大亚湾生态监控区  生态系统处于亚健康状态。海水氮磷比失衡。部分生物体内铅和镉含量较高。生物群落结构状况异常，浮游植物数量高于正常波动范围，物种多样性较差，均匀度一般，春季浮游植物平均密度为689×104个细胞/立方米，物种多样性指数变化范围为1.03~2.43，平均为1.83，均匀度变化范围为0.30~0.65，平均为0.51；底栖生物密度低于正常波动范围，物种多样性和均匀度处于一般水平，春季平均栖息密度为88个/平方米，物种多样性指数变化范围为0.65~3.89，平均为2.04，均匀度变化范围为0.14~0.90，平均为0.46。

　　大亚湾天然红树林主要分布在西北部的白寿湾和东北部的范和港，多年来红树林已受到严重破坏，目前面积不足0.04平方公里。大亚湾沿岸适合红树林生长的滩涂较多，2000年，惠州市开始筹建红树林自然保护区，种植人工红树林；2005年，在大亚湾红树林园内，新植红树林树种成活率达到95％以上，红树林品种已达6种，林木面积超过180亩，人工红树林已基本形成群落，长势良好。 

天然红树林被虾池鱼塘吞噬	人工红树林郁郁葱葱

   
　　近年来，由于大型石化工厂及其配套港口的建设，附近水域的海底生境已发生很大改变，鱼、虾、蟹、贝类的产卵场、索饵场、越冬场和洄游通道均遭到不同程度的破坏。大亚湾渔业资源衰退，海洋捕捞产量逐年下降，渔获物质量降低。
　　连续四年的监测结果表明，大亚湾生态系统存在的主要生态问题为生境改变、生物群落结构异常和环境污染。主要影响因素是围填海、“热污染”和陆源排污。
　　珠江口生态监控区  生态系统处于不健康状态。水体呈严重富营养化状态，氮磷比失衡，近80%水域无机氮含量劣于四类海水水质标准。部分生物体内铅、镉、六六六和石油烃含量偏高。栖息地变化较大。生物群落结构状况较差，赤潮生物种类和数量在珠江口浮游植物组成中均占有明显的优势，浮游植物密度高于正常波动范围，物种多样性、均匀度较差，夏季平均密度为11 562×104个细胞/立方米，物种多样性指数变化范围为0.06~2.51，平均为0.82，均匀度变化范围为0.02~0.97，平均为0.33；浮游动物密度明显低于正常波动范围，春季和夏季密度分别为1 461个/立方米和1 468个/立方米。

　　珠江口北部海区航道工程严重影响了底栖生物生存环境，大型底栖生物极少，生物多样性较差，优势种变化较大。海区主要产卵种类为经济价值较低的小型鱼类，经济价值较高的舌鳎科等鱼类资源衰退。珠江口海区浅近海的颌圆鲹和中国枪乌贼种群处于充分开发状态，齿蛇鲻、花斑蛇鲻、蓝圆鲹、金线鱼和黄鳍马面鲀种群存在不同程度的过度开发。
　　珠江口海区的中华白海豚种群资源量最为丰富，且种群世代最完整。但近几年来，珠江口大型海洋工程的不断开发，频繁的船只来往，以及环境污染和过度捕捞等都对中华白海豚的数量产生影响。
　　连续四年的监测结果表明，珠江口生态系统存在的主要生态问题为富营养化、环境污染、生物群落结构异常、渔业资源衰退和生境改变。历年丰水期无机氮的平均含量均劣于四类海水水质标准；贝类、鱼类和甲壳类体内铅含量普遍上升；赤潮生物始终是珠江口浮游植物的主要组成部分，其种类和数量均占明显优势，容易诱发赤潮；浮游植物个体数量有由春季高于夏季向夏季高于春季转变的趋势，群落结构趋向简单化。主要影响因素是陆源排污、围填海和过度捕捞。
　　雷州半岛西南沿岸生态监控区  生态系统处于亚健康状态。多数区域石油类含量超一类海水水质标准，4月份和8月份的超标率分别为42%和56%。部分海洋生物体内汞含量偏高。沉积物质量优良。

　　徐闻珊瑚礁活珊瑚的平均覆盖率为23.2%。珊瑚礁主要分布区的活珊瑚礁盖度分别为14.5~31%，较2004年有所降低，未出现新近死亡或严重白化、病害等情况，但调查区珊瑚上依然有大量沉积物覆盖。
8月份，浮游植物平均密度高于正常波动范围，为196×104细胞/立方米；浮游动物密度属中等水平，平均216个/立方米，生物量普遍偏低，平均30.5毫克/立方米；底栖生物的栖息密度和生物量低于正常波动范围，分别为27个/平方米和5.0克/平方米；鱼卵、仔鱼密度偏低，平均密度分别为0.14个/立方米和0.15尾/立方米。
　　2002~2006年湛江市先后投放15艘转产转业淘汰渔船（4 500立方米）和360个钢筋混凝土礁体（7 200立方米）实施人工鱼礁渔业资源恢复行动计划。与2004年本底调查及对照区相比，雷州乌石人工鱼礁区渔业资源恢复行动初见成效。流刺网跟踪调查显示，礁区游泳生物的渔获种数是本底调查和对照区的1.5倍，资源密度是本底调查的13.5倍，对照区的10.3倍。
　　连续四年的监测表明，该区域水体石油类污染加重，海洋生物在一定程度上受到汞污染；珊瑚礁分布区悬浮物含量高，珊瑚礁表面沉积物覆盖严重，生长受到影响，人为干扰和破坏现象仍然存在。
　　广西北海生态监控区  生态系统处于健康状态。水环境和沉积环境总体质量良好。红树林生态系统群落类型基本保持不变，维持原有的种类多样性和生境完整性；成体植株胸径、株高和密度等指标变化均不明显。永安核心区土壤含盐量26.0‰，群落外貌深绿，林相齐整，乔木型木榄占优，木榄群落植株密度11 106~14 007株/公顷，覆盖度95%以上，群落内部混生的白骨壤植株具广州小斑螟虫害。沙田缓冲区含盐量31.3‰，群落外貌银灰色，为单层灌木型白骨壤群落，群落植株密度11 106株/公顷，覆盖率70%左右，植株广州小斑螟虫害严重。红树林底栖动物种类丰富，生物量高，甲壳动物、软体动物和星虫动物占优势。

　　2007年英罗红树林区共有7种鹭鸟分布，即白鹭、池鹭、绿鹭、夜鹭、牛背鹭、黄嘴白鹭和黄斑苇鳽，其中黄嘴白鹭和黄斑苇鳽属国家二级重点保护动物，黄嘴白鹭还被列入世界自然保护联盟濒危动物红皮书名录。
　　本区红树林生态系统健康的主要威胁是虫害和互花米草入侵。红树林虫害仍然是白骨壤广州小斑螟虫害，危害面积约1 200亩，主要分布在沙田、永安、白沙和武留江口，但与前三年相比，白骨虫害程度明显减轻。互花米草、红树林空间竞争监测表明，互花米草的平均高度、密度、盖度和平均生物量等逐年增长，单面直线的扩展速率达到每年139.5厘米，互花米草斑块样方面积扩展速率达到每年28.9~32.8平方米。
　　往年监测的淀沙洲下量尾和英罗港乌坭两处海草分布区，因受到挖掘沙虫和耙螺等人为活动影响均遭受严重破坏，下量尾喜盐草生境已破坏殆尽，乌坭喜盐草尚存零星分布，但长势极差。今年在丹兜海实验区边缘发现生长长势良好的海草，面积约120亩，盖度占30~40%，为喜盐草和二药藻混生，以喜盐草占优。该草场中心位置点处的喜盐草长势相当好，面积约3亩，大部分处在潮下带。
　　涠洲岛竹蔗寮近岸海域的珊瑚礁硬珊瑚盖度为42.5%，没有大量出现新生的珊瑚及珊瑚白化或死亡现象，是较典型的稳定型珊瑚礁底质类型。公山近岸海域的珊瑚礁底质绝大部分为砾石（占48.8%）和岩石（占28.8%），几乎未记录到硬珊瑚，表明这一区域在2002年起发生的大面积的珊瑚死亡事件后，至今仍未恢复；最近死亡珊瑚、珊瑚补充量、营养化指示海藻及海绵等指标在珊瑚礁分布区所占比例很小，表明该区域珊瑚礁没有出现继续死亡和明显恢复的迹象。
　　北仑河口生态监控区  生态系统处于健康状态。水环境基本良好，但局部区域活性磷酸盐和无机氮含量出现超一类海水水质标准的现象。沉积环境总体质量良好。

　　红树林群落类型不变，继续维持原有的种类多样性和生境完整性。交东区域近岸一侧为秋茄群落，近海一侧为木榄单生群落。秋茄群落大树植株平均高度为1.80米，平均胸径13.7厘米，幼树1.2株/平方米；木榄群落大树植株平均株高3.13米，平均胸径10.9厘米。竹山区域以桐花树和白骨壤为主。该区桐花树纯林整体郁闭度达90％以上，大树植株平均株高1.4米，平均胸径4.2厘米，桐花树幼苗平均密度为2.5株/平方米，发育良好。
　　北仑河口红树林生态系统位于亚洲东部沿海鸟类迁徙路线和中西伯利亚-中国中部鸟类迁徙路线的交汇区，是候鸟重要繁殖地和迁徙停歇地，鸟类种类多样性十分丰富。交东区域4月、7月和10月的三次监测分别观察到鸟类41种、37种和42种；石角片区域4月、7月和10月的三次监测分别观察到鸟类53种、37种和50种。红树林区底栖动物丰富，平均栖息密度和生物量分别为168个/平方米和115克/平方米。
　　2005年以来的监测结果表明，北仑河口生态监控区的主要威胁是独墩及竹山区域水体受无机氮及活性磷酸盐污染较重，污染源来自上游东兴市的市政污水及附近养殖塘养殖污水的排放。
海南东海岸生态监控区  生态系统处于健康状态。珊瑚礁及海草床监测区域水质优良。造礁石珊瑚生长发育良好，珊瑚礁鱼类种类及数量丰富，未发现珊瑚礁病害，珊瑚礁生态系统处于稳定的恢复阶段。
　　海南省东部海岸活造礁珊瑚覆盖度平均为40.6%，亚龙湾最高，为77.2%，鹿回头和龙湾最低，为15.7%；硬珊瑚补充量明显高于上一年，平均值为1.2个/平方米，长玘港最高，为2.7个/平方米，亚龙湾和蜈支洲最低，为0.4个/平方米。珊瑚礁鱼类分布普遍较多，亚龙湾和蜈支洲分别达到364尾/百平方米和191尾/百平方米。海南东海岸海草种类多样性丰富，生长状况总体良好。2004年以来海南东海岸共发现8种海草分布，海草伴生生物种类丰富，共有87种。

　　滨海旅游、海水养殖和围填海等开发活动均对海南东海岸珊瑚礁和海草床产生一定威胁。2004年在黎安港首次发现的针叶藻分布区因开挖对虾养殖池已消失；由于过度捕捞，珊瑚分布区多为小型经济鱼类和观赏性鱼类，大型贝类和鱼类极少；围填海工程导致鹿回头近岸海水浑浊，影响了珊瑚礁的正常生长；鹿回头、大小东海、东瑁州、西瑁州、东西排岛和蜈支洲岛内潜水点均发现珊瑚被踩断现象。
　　西沙珊瑚礁生态监控区  生态系统处于健康状态。环境总体质量良好。西沙群岛珊瑚礁生长发育良好，珊瑚及珊瑚礁鱼类种类极为丰富。活造礁珊瑚覆盖度高，平均68.2%。石岛西部、赵述岛南部活造礁珊瑚覆盖度最高，分别为76.8%和76.7%，其次是永兴岛东部和西沙洲南部，覆盖度分别为69.5%和68.7%，北岛西南部最低，为49.3%；上述各区均发现新近死亡珊瑚，硬珊瑚的补充量均很高，平均为0.7个/平方米，最高达1.3个/平方米；珊瑚礁鱼类分布密度高，平均达到213尾/百平方米。

　　2005年以来的监测结果显示，西沙近岸珊瑚礁生态系统保持其自然属性，生物多样性及生态系统结构稳定。但在永兴岛、西沙洲南部均发现成片的伞房鹿角珊瑚白化现象，在永兴岛南部还发现部分叶状蔷薇珊瑚变黑现象。