2007年，全海域共发生赤潮82次，较2006年减少12%；累计面积11 610平方公里，较2006年减少41%。其中，在赤潮监控区内及毗邻海域发生赤潮30次，累计面积约3 184平方公里，分别占全海域赤潮累计发生次数和面积的37%和27%。

2006~2007年全国各海区赤潮发生情况对比

　　全海域共发生100平方公里以上的赤潮30次，累计面积10 253平方公里，分别占赤潮发生总次数和累计总面积的37%和88%；其中，面积超过1 000平方公里的赤潮1次，较上年减少6次，发生面积仅为上年的五分之一。赤潮高发区仍集中在东海海域，其赤潮发生次数和累计面积分别占全海域的73%和84%。

2001~2007年全国赤潮发生次数及发生面积

　　2007年，我国海域引发赤潮的生物种类主要为无毒性的中肋骨条藻、角毛藻、具齿原甲藻和具有毒害作用的米氏凯伦藻、棕囊藻、链状裸甲藻、亚历山大藻等。有毒赤潮生物引发或协同引发的赤潮25次，累计面积1 906平方公里，占全年赤潮累计发生次数和面积的31%和16%，发生次数和累计面积均比上年有较明显减少。

2007年全海域发生的较大面积赤潮

　　渤海  全年共发生赤潮7次，累计面积672平方公里，发生次数较2006年减少4次，累计面积减少2 308平方公里，未发生500平方公里以上的赤潮。

　　黄海  全年共发生赤潮5次，累计面积655平方公里，发生次数与累计面积较上年分别增加3次和235平方公里。7月份在江苏海州湾连续发生2次海链藻赤潮，累计面积约占黄海赤潮发生总面积的87%。

　　东海  全年共发生赤潮60次，累计面积约9 800平方公里，赤潮发生次数较上年减少3次，累计面积减少5 383平方公里。赤潮高发期集中在5~7月，赤潮发生次数与累计面积分别占全年度的72%和47%。与往年不同的是，今年5~6月东海近岸海域未发生超过1 000平方公里的大面积赤潮，在长江口外海域和浙江中、南部海域发生的最大面积赤潮仅有700平方公里，且大都持续时间很短，没出现大面积的爆发。

　　南海  全年共发生赤潮10次，累计面积496平方公里。赤潮发生次数和累计面积分别较上年减少7次和774平方公里，是近五年来南海发生赤潮次数和面积最少的一年。南海赤潮的优势种类主要为对养殖生物具有毒害作用的棕囊藻。